فهرست مطالب
عنوان شماره صفحه
چکیده.. 1
فصل اول: کلیات تحقیق
مقدمه.. 3
1-1- مورفولوژی روده بزرگ.. 4
1-1-1 سکوم و آپاندیس.. 4
1-1-2 کلون.. 5
1-2- بیماریهای روده بزرگ.. 6
1-2-1 آپاندیسیت.. 6
1-2-2 عفونتهای داخل شکمی.. 7
1-2-3 بواسیر.. 7
1-2-4 سرطان روده بزرگ.. 7
1-3- فلورروده.. 8
1-4- نقشهای مهم فلور طبیعی روده.. 10
1-5- تاثیر آنتی بیوتیکها برروی فلور روده.. 12
1-6- علایم خارج شدن توازن باکتریهای روده.. 13
1-7- پروبیوتیکها.. 13
1-8- منافع مصرف پروبیوتیکها.. 13
1-9- اشکال پروبیوتیکها.. 14
1-10- پری بیوتیکها.. 14
1-11- باکتریهای بیهوازی احیاکننده سولفات.. 15
1-12- نقش باکتریهای احیا کننده سولفات در طبیعت.. 15
1-13- نقش باکتریهای احیا کننده سولفات در صنعت نفت.. 16
1-14- خوردگی میکروبی.. 16
1-15- واکنشهای احیای ترموشیمیایی سولفات.. 17
1-16- سیستمهای آلوده به SRB.. 17
1-17- اهداف، فرضیات و پرسش اصلی پژوهش.. 18
1-17-1 اهداف اصلی.. 18
1-17-2 اهداف اختصاصی.. 18
1-17-3 اهداف کاربردی.. 18
1-17-4 فرضیات پژوهش.. 18
1-17-5 پرسش اصلی پژوهش.. 18
فصل دوم: پیشینه پژوهش
2-1- پژوهشهای انجام گرفته در سطح جهان.. 20
2-2- پژوهشهای انجام گرفته در ایران.. 23
فصل سوم: روش شناسی تحقیق
3-1- مواد و روش کار.. 25
3-2- محیط کشت مورد نیاز.. 26
3-3- انتخاب بیماران مورد نظر برای نمونهبرداری.. 26
3-4- ارزیابی تاثیر آنتی بیوتیک ها برروی باکتریهای SRB.. 30
3-4-1 آنتی بیوتیک کلیندامایسین.. 30
3-4-2 آنتی بیوتیک جنتامایسین.. 31
3-4-3 آنتی بیوتیک مترونیدازول.. 31
3-5- ارزیابی خواص ضدمیکروبی آنتی بیوتیکها بر باکتریهای SRB مثبت 32
3-6- تعیین هویت مولکولی باکتریهای SRB مثبت.. 33
3-7- آنالیز آماری.. 33
فصل چهارم: نتایج یافته های تحقیق
4-1- مقدمه.. 35
4-2- تجزیه و تحلیل نتایج جمعیت شناختی.. 35
4-2-1 جنسیت.. 36
4-2-2 سن.. 37
4-2-3 میزان تحصیلات.. 38
4-2-4 میزان درآمد.. 39
4-3- ارزیابی فرضیات پژوهش.. 40
4-3-1 فرضیه اول.. 40
4-3-2 فرضیه دوم.. 43
4-3-3 فرضیه سوم.. 45
4-3-4 فرضیه چهارم.. 47
4-3-5 فرضیه پنجم.. 48
4-3-6 فرضیه ششم.. 50
4-4- نتایج آزمایش PCR.. 54
4-4-1 تأیید استخراج DNA.. 54
4-4-2 تأیید PCR ژن16S rRNA.. 55
4-4-3 توالی تعیین ترادف شده قطعه 16S rRNA.. 56
4-4-4 آنالیز فیلوژنتیکی.. 57
فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری
5-1- بحث.. 63
5-2- نتیجه گیری.. 67
5-3- پیشنهادات.. 67
منابع و مآخذ.. 68
فهرست منابع فارسی.. 68
فهرست منابع انگلیسی.. 70
چکیده انگلیسی.. 73
فهرست جداول
عنوان شماره صفحه
جدول 3-1: پرسشنامه مورد استفاده در این پژوهش. 25
جدول 3-2: ترکیبات محیط کشت API 26
جدول 3-3: خصوصیات بالینی افراد انتخاب شده برای نمونهبرداری 28
جدول 4-1: توزیع فراوانی و افراد بر حسب جنسیت. 36
جدول 4-2: فراوانی افراد مورد پژوهش بر حسب گروههای سنی. 37
جدول 4-3: توزیع فراوانی و در پاسخ دهندگان بر حسب میزان تحصیلات 38
جدول 4-4: فراوانی افراد مورد پژوهش بر حسب میزان درآمد 39
جدول 4-5: فراوانی افراد مورد پژوهش بر حسب گروه های سنی و بیماری 40
جدول 4-6: ضریب همبستگی متغیرهای سن افراد و بیماری. 42
جدول 4-7: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس درامد و بیماری 43
جدول 4-8: ضریب همبستگی متغیرهای سن افراد و بیماری. 44
جدول 4-9: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس سابقه بیماری و بیماری 45
جدول 4-10: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس جنسیت و سابقه مصرف آنتیبیوتیک. 47
جدول 4-11: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس گروه سنی و تحصیلات 48
جدول 4-12: ضریب همبستگی متغیرهای تحصیلات افراد و بیماری 49
جدول 4-13: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس گروه های سنی وتاثیر آنتیبیوتیکها. 50
جدول 4-14: ضریب همبستگی متغیرهای سن و تاثیر داروی. 51
جدول 4-15: ضریب همبستگی متغیرهای سن و تاثیر داروی جنتامایسین 52
جدول 4-16: ضریب همبستگی متغیرهای سن و تاثیر داروی مترونیدازول 53
فهرست نمودارها
عنوان شماره صفحه
نمودار 4-1: فراوانی و نسبت افراد مورد پژوهش بر حسب جنس 36
نمودار 4-2: توزیع درصد نمونه آماری افراد برحسب سن. 36
نمودار 4-3: فراوانی افراد مورد پژوهش بر حسب میزان تحصیلات 38
نمودار 4-4: توزیع در صد نمونه آماری افراد بر حسب میزان درآمد 39
نمودار 4-5: نمودار توافقی سن و بیماری آپاندیسیت. 41
نمودار 4-6: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس آپاندیسیت 41
نمودار 4-7: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس درامد و بیماری 43
نمودار 4-8: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس سابقه بیماری و بیماری آپاندیسیت. 46
نمودار 4-9: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس سابقه بیماری و بیماری عفونت روده. 46
نمودار 4-10: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس جنسیت و سابقه مصرف آنتیبیوتیک. 47
نمودار 4-11: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس گروه سنی و تحصیلات 48
نمودا 4-12: ارزیابی تاثیر کیفی داروی کلیندامایسین بر باکتریهای احیا کننده سولفات جدا شده از گروههای سنی. 51
نمودار 4-13: ارزیابی تاثیر کیفی داروی جنتامایسین بر باکتری های احیا کننده سولفات جدا شده از گروه های سنی. 52
نمودار 4-14: ارزیابی تاثیر کیفی داروی مترونیدازول بر باکتریهای احیا کننده سولفات جدا شده از گروههای سنی. 53
فهرست شکل ها
عنوان شماره صفحه
شکل 1-1: آپاندیس ملتهب و متورم (آپاندیسیت).. 6
شکل 1-2: فلور طبیعی روده.. 10
شکل 3-1: مرحله جداکردن زائده آپاندیس.. 27
شکل 3-2: تلقیح باکتریهای SRB)) به محیط مایع API. 30
شکل 3-3: تاثیر آنتی بیوتیکها بر رشد باکتری های SRB.. 32
شکل 4-1: تصویر الکتروفورز حاصل از DNA استخراج شده از باکتری. 54
شکل 4-2: تصویر الکتروفورز حاصل از تکثیر ژن 16S rRNA باکتری. 55
چکیده
باکتریهای احیا کننده سولفات (SRB) گروه بزرگی از میکروارگانیسمهای بیهوازی هستند که نقش بسیار مهمی در بسیاری از فرآیندهای بیوژئوشیمیایی ایفا میکنند. این پژوهش با هدف شناسایی وتعیین هویت مولکولی باکتریهای احیا کننده سولفات و نقش آنها در عفونتهای روده بزرگ و آپاندیسیت در شهر کرمان انجام شد. روش کار: این پژوهش به صورت مقطعی-توصیفی در سال 1391 تا 1392 بر روی 50 بیمار مراجعه کننده به بیمارستانهای مختلف شهر کرمان انجام شد. تمامی افراد مورد بررسی دارای مشکلات عفونت روده بزرگ ویا آپاندیسیت بودند. در بین این افراد نمونهگیری از حفره شکم و روده ی بزرگ انجام شد. سپس نمونههای تهیه شده به محیط کشت اختصاصی API تلقیح و 2 ماه در دمای 35 درجه سانتی گراد گرماگذاری شدند. سپس نمونههای مثبت پس از کشت مجدد در محیط جامد اختصاصیSRB ، برای خالص سازی بیشتر به محیط جدید API منتقل گردید. شناسایی مولکولی جدایه ها با استفاده از پرایمر یونیورسال 16s rRNA و مقاومت آنتی بیوتیکی صورت گرفت. از مجموع نمونههای مورد پژوهش از6 مورد (12%) نمونههای مشکوک به SRB جداسازی گردید. اما با روش مولکولی در4 مورد (8%) باکتری های احیا کننده سولفات شناسایی شد. بیشترین گونه ی باکتریهای (SRB) مربوط به سویه Desulfovibrio piger بود. همچنین بین جداسازی باکتریهای SRB، سن و میزان تحصیلات افراد ارتباط معنیداری مشاهده شد مناسبترین آنتیبیوتیک برای حذف باکتریهای SRB کلیندامایسین شناسایی شد. با توجه به نقش احتمالی باکتریهای SRB در ایجاد سرطان کلون و عفونتهای رودهای، ضرورت انجام پژوهشهای تکمیلی و پایش مداوم بالینی در جمعیتهای گسترده تر و ارزیابی نقش بیوسایدها وآنتیبیوتیکها در حذف این باکتریها وجود دارد.
واژگان کلیدی: باکتریهای احیا کننده سولفات، عفونتهای روده بزرگ، 16s rRNA
